Projekt: Tillväxthormon

Elvira Carlén

Intro

Korrelationsanalys:
- Korrelation mellan alla parametrar som har används vid modullering
- Plottar: Parametrar med högst korelation
Relation mellan igf-1 sds, homa-ir och HbA1c
Modell: Explainable Boosting Machine (EBM)
Modell: Symbolisk Regression

Korrelationsanalys

Varför? Vissa metoder (t ex modellen “LASSO Regression”) fungerar dåligt om det finns en hög korrelation mellan parametrar. Modeller som “Elastic Net” fungerar bättre med hög korrelation
Metod: Spearman’s rank correlation

Plottar: Korrelation

Summering
(ostradiol vs testosteron)
(age vs testosteron)
(testicle_size vs testosteron)
(ostradiol vs testicle_size)
(age vs testicle size)
(age vs ostradiol)
(birth weight vs birth length)
(perc_change_igf1_gh_dos_date_3m vs perc_change_igf1_gh_dos_date_1y)
(birth length vs height velocity 0)
(ostradiol vs igf_1)
(igf_1 vs testosteron)
(testicle size vs igf_1)
(age vs igf_1)

Relation mellan igf-1, insulin, glukos and HbA1c

Tabell: antal datapunkter
HbA1c vs igf1-sds
homa-ir vs igf1-sds
Enskilda patienter: igf1-sds, Hba1c, homa-ir
Alla patienter: Hba1c, homa-ir, igf1-sds
Alla patienter: Hba1c
Alla patienter: homa-ir
Alla patienter: igf1-sds

	phase	igf_1	f_insulin	f_glucose	hb_a_1c	4/4 columns
sex
Loading ITables v2.1.3 from the internet... (need help?)

Modell: Explainable Boosting Machine (EBM)

Plottar: Viktiga parametrar för modellen

Summering
igf_1
age
sd weight
gh dose prop
perc change igf-1 3m
heigth velocity 1
testicle size
birth length
perc change igf-1 1y
target height deficit sds
gh max stim
age gh start
birth weight
heigth velocity 0
height velocity gh start

Mean absolute score: medelvärdet av det absoluta predikterade värdet för varje parameter i träningsdatan

“Height_velocity_1: change in height over 1 year for age 1-2”

“Height_velocity_0: change in height over 1 year for age 0-1”

Plottar: Bedömning av enskilda individer

Person 1
Person 2
Person 3
Person 4
Person 5

Modell: Symbolisk Regression

Vad gör modellen?

Plottar: Symbolisk Regression

Summering
Räkning av parametrar: Modeller med top 5 högst “Test R2”

Tree Depth	Evaluations	Finetune Coefs	Evaluations limit for fine-tuning	Train R2	Train MSE	Test R2	Test MSE	Model	Complexity
Loading ITables v2.1.3 from the internet... (need help?)

	Frequency
Variable
Loading ITables v2.1.3 from the internet... (need help?)